期刊在线咨询服务,发表咨询:400-888-9411 订阅咨询:400-888-1571股权代码(211862)

期刊咨询 杂志订阅 购物车(0)

大豆GmANKTM家族非生物胁迫生物信息学分析

柏锡; 王昕奕; 陈云; 杨亚男; 黄荣梅; 郑佳佳; 王佳 东北农业大学生命科学学院; 哈尔滨150030

关键词:大豆 anktm家族 生物信息学 非生物胁迫 

摘要:ANKTM(Ankyrin repeats transmembrane)蛋白属锚蛋白超家族,包含ANK基序和跨膜结构域,在非生物胁迫、生物胁迫、诱发衰老中起重要作用。为了解大豆ANKTM(Ankyrin repeats transmembrane)家族成员及其胁迫响应规律,利用生物信息学和q-PCR方法研究大豆ANKTM家族成员。结果表明,从大豆中鉴定出62个ANKTM家族基因,分为5个亚家族。该家族编码蛋白含346~1 039个氨基酸,分子质量为37.88~114.83 ku,等电点(pI)为4.46~9.61。分析蛋白结构域发现,GmANKTM家族含ANK基序和跨膜结构域,58个基因含PGG结构域,此外还含ACBP、SBP、DHHC、G-PCR等其他结构域。除ANK基序、跨膜结构域和PGG结构域外其他结构域主要集中在第5亚家族。其余亚家族结构域分布位置和数量相近。启动子区域顺式元件分析发现,GmANKTM家族基因含光响应元件、激素响应相关元件和逆境响应相关元件。组织分析发现GmANKTM家族第5亚家族组织表达量高于其他亚家族。利用大豆转录组数据库分析发现,GmANKTM家族基因受盐胁迫和干旱胁迫强烈诱导。

东北农业大学学报杂志要求:

{1}来稿请注明作者、单位、职称或职务、联系方式及邮寄地址。合著稿件署名时须征得其他作者同意,确定先后次序。

{2}本刊对来稿有权作必要的技术性和文字性修改。

{3}来稿不退,请作者自留备稿。来稿一经发表,文章的复制权、发行权、汇编权及信息网络传播权将独家授予《传播与版权》期刊编辑部。

{4}参考文献:参考文献位于文尾,按首字的拼音首字母顺序排序,用序号[1]、[2]、[3]、[4]……标示,若只有一个参考文献,则文献前不加序号。

{5}关键词:3-5个词条,用逗号隔开;英文关键词词组首字母大写。

注:因版权方要求,不能公开全文,如需全文,请咨询杂志社

东北农业大学学报

北大期刊
1-3个月下单

关注 34人评论|4人关注
相关期刊
服务与支付