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巨龙竹肉桂醇脱氢酶基因(DsCAD)的克隆及功能分析

孙金金; 朱金鑫; 王娟; 杨宇明; 西南林业大学; 云南省林业科学院国家林业局云南珍稀濒特森林植物繁育和保护重点实验室; 云南省林业科学院云南省森林培育与开发利用重点实验室

关键词:肉桂醇脱氢酶 巨龙竹 基因克隆 荧光定量 

摘要:肉桂醇脱氢酶(cinnamyl alcohol dehydrogenase,CAD)是木质素生物合成途径的关键酶。研究根据巨龙竹转录组数据设计的一对特异引物,运用逆转录PCR(RT-PCR)技术从巨龙竹茎秆中克隆得到肉桂醇脱氢酶基因DsCAD,该基因包含1080 bp的完整c DNA开放阅读框,编码359个氨基酸,理论相对分子质量38689.6,等电点6.18。利用生物信息学方法对DsCAD进行分析,结果显示:DsCAD氨基酸序列包含CAD超家族的保守结构域,具有植物CAD基因的典型特征;其与禾本科植物CAD基因的同源性较高,亲缘关系较近,其中与孝顺竹的同源性高达95%。荧光定量PCR检测结果显示DsCAD基因在巨龙竹竹笋中的表达量要高于茎秆,而在茎秆中的表达量有明显高于叶。

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