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电子克隆获取甜菜富亮氨酸类受体蛋白激酶基因BvLRR-RPK2;1完整编码区

王希; 陈丽; 赵春雷 中国农业科学院甜菜研究所/黑龙江大学农作物研究院; 哈尔滨150080; 黑龙江省普通高等学校甜菜遗传育种重点实验室; 哈尔滨150080; 中国农业科学院北方糖料作物资源与利用重点开放实验室; 哈尔滨150080

关键词:甜菜 基因克隆 电子克隆 完整编码区 

摘要:针对前期获得的甜菜分子标记位点进行分析,以获得甜菜中该位点相关的基因。结合电子克隆与常规克隆,获取并验证目的基因片段,最后预测基因产物结构与功能。结果获得了一段长3467bp的片段,其中包含一个长3141bp的完整编码区,编码一个长1046aa的富亮氨酸类受体蛋白激酶。将基因命名为BvLRR-RPK2;1。基因编码区在基因组中连续存在,无内含子区域。基因翻译产物BvLRR-RPK2;1具有一个跨膜结构域,具有LRR-RPK家族的特征性结构域,与已知的LRR-RPK/RLK类蛋白序列相似性在85%以下,与甜菜本身的预测序列在编码区内部有5个碱基、2个氨基酸的差异。本文获得了一个甜菜中未经克隆的LRR-RPK2编码区,并预测了其产物功能。

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