期刊在线咨询服务,发表咨询:400-888-9411 订阅咨询:400-888-1571股权代码(211862)
关键词:云南省 伯氨喹 溶血 突变 空间结构
摘要:目的分析伯氨喹诱发溶血患者的葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(G6PD)基因突变对空间结构形成的影响。方法于2018年5月18日采集1例因服用伯氨喹出现溶血反应、G6PD酶活性下降75%的间日疟病例血样。提取血样的人基因组DNA,通过PCR分别扩增含G6PD基因exon2、exon3-7、exon8-9和exon10-13等12个外显子的片段并测序。整理获得的DNA序列与G6PD基因野生型、突变型序列比对,以确认12个外显子分别的起止点并拼接成exon2-13外显子的cDNA序列。用MEGA5.04软件分析cDNA序列的错义突变、同义突变和进行氨基酸链转换。采用SWISS-MODEL预测氨基酸链空间结构(www.swissmodel.expasy.org/interactive),PyMOL2.2.0软件修饰空间结构预测图。结果间日疟患者血样基因组经4个PCR反应体系扩增,分别获得含G6PD基因exon2、exon3-7、exon8-9、exon10-13外显子的336、2277、976和1421bp等4种目标产物。由测序结果整理获得12个外显子的cDNA链为1545bp,与野生型序列比对的同义突变、错义突变位点分别为c.1311T>C和c.1376G>T,导致437、459氨基酸呈Y/Y不变和R/L变异,空间位置均未在G6PD与NADP^+、乙醇酸配体的结合区。515aa氨基酸链的二聚体空间结构模型GMQE、QMEAN分别为0.97和0.66,建模质量高,与野生型模型(6eO7.1.A)比对,459氨基酸均处于模型表面,与NADP^+配体的结合区均包括238、357等16个残基;四聚体的建模质量略差,乙醇酸的配体结合区仅为47等6个残基,少于野生型的11个。结论G6PD基因编码区C.1311T>C同义突变与C.1376G>T错义突变同时存在,可能不影响该患者G6PD二个亚基的聚合及其与NADP+配体的结合,但四聚体的形成受到干扰。
中国寄生虫学与寄生虫病杂志要求:
{1}优先刊发创新性学术论文及依托部级、省级科研立项课题的研究成果。
{2}稿件应有一定的学术水平和实践推广价值。
{3}文稿中的小标题请依次使用:一、二、三、……;(一)(二)(三)……;1.2.3.……;(1)(2)(3)……;①②③……。
{4}为方便前后文献对照检查,在投稿时作者应在文内的右上角标注序号,文后的参考文献也对应地标上序号,以免重复或漏掉文献。
{5}不同单位的作者,应在姓名右上角加注阿拉伯数字序号,并在其工作单位名称之前加注与作者姓名序号相同的数字,各工作单位之间以分号隔开。
注:因版权方要求,不能公开全文,如需全文,请咨询杂志社