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以非洲猪瘟病毒DNA聚合酶X为靶点的海洋药物计算机虚拟筛选

王卓亚; 李阳阳; 徐锡明; 于日磊; 魏志强; 杨金波 兰州大学生命科学学院; 甘肃兰州730000; 中国海洋大学青岛海洋科学与技术试点国家实验室; 山东青岛266237; 江苏理工学院生物信息与医药工程研究所; 江苏常州213001

关键词:非洲猪瘟病毒 天然产物 海洋化合物 非洲猪瘟病毒dna聚合酶x 虚拟筛选 

摘要:目的从天然产物中高效快速地筛选出一批有效针对非洲猪瘟病毒的药物苗头化合物,为寻找能抑制猪瘟蔓延的生物饲料提供线索。方法利用计算机辅助药物设计技术,以非洲猪瘟病毒DNA聚合酶X的DNA结合区为靶点,进行虚拟筛选,在陆生和海洋天然产物中,化合物通过文献搜索和数据库查询明确部分天然产物的来源。结果从陆生天然产物库中筛选出16个苗头化合物,其中有5个源自中国;在海洋化合物数据库Marin Chem3D中得到了59个苗头化合物,其中有8个源自中国。结论中国境内分布有13种潜在的具抑制非洲猪瘟效果的天然产物,其中大部分来源于海洋生物。

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