期刊在线咨询服务,发表咨询:400-888-9411 订阅咨询:400-888-1571股权代码(211862)

期刊咨询 杂志订阅 购物车(0)

高通量测序分析云南腾冲热海热泉微生物多样性

秦亚玲; 梁宗林; 宋阳; 王保军; 刘双江; 姜成英 中国科学院微生物研究所微生物资源前期开发国家重点实验室; 北京100101; 中国科学院生态环境研究中心环境生物技术重点实验室; 北京100085; 中国科学院大学; 北京100049; 中国科学院环境微生物技术联合实验室; 北京100101

关键词:热海热泉 高通量测序 微生物多样性 硫氧化微生物 

摘要:【背景】云南腾冲热海热泉中蕴含着丰富的极端微生物资源。【目的】揭示云南腾冲热海热泉中微生物物种多样性及群落结构差异,发掘酸性热泉中铁、硫氧化功能微生物。【方法】采用Illumina HiSeq高通量测序技术对3处热泉15个水体样品中微生物16SrRNA基因V4-V5区进行测序及生物信息学分析。【结果】3处热泉中共获得578061条有效序列,聚类为141个可操作分类单元(Operational taxonomic unit,OTU),包括19个门66个属。鼓鸣泉(GMQ)、蛤蟆嘴(HMZ)、黄瓜箐(HGQ)3处热泉均以泉古菌门(Crenarchaeota)和厚壁菌门(Firmicute)为主。从属水平分析,碱性热泉鼓鸣泉(GMQ)和中性热泉蛤蟆嘴(HMZ)分别注释到37、32个属,优势属均为芽孢杆菌属(Bacillus)和热棒菌属(Pyrobaculum)。酸性热泉黄瓜箐(HGQ)共注释到20个属,优势属为酸杆菌属(Acidibacillus)和酸硫杆状菌属(Acidithiobacillus),此外,具有铁、硫氧化潜力的菌属有喜酸菌属(Acidicaldus)、硫化芽孢杆菌属(Sulfobacillus)、硫化叶菌属(Sulfolobus)及生金球菌属(Metallosphaera)等,进一步通过硫氧化培养基分离获得了这些菌属中的纯菌株。【结论】云南腾冲热海热泉水体中蕴含丰富的微生物资源,热泉间微生物物种组成差异明显;酸性热泉中存在多种具有潜在铁、硫代谢功能的菌种;未分类类群、非培养类群丰度很高,尤其是蕴藏着可观的古菌资源。

微生物学通报杂志要求:

{1}来稿研究内容如属各级基金资助项目,须在首页脚注标明其名称,并注明编号。

{2}来稿应严谨遵守学术规范,内容表述清晰,语言流畅通达,逻辑严密。

{3}内文的图、表,请按规范要求绘制,并标明图序、表序、图题、表题。

{4}注释:是作者对文章某一内容或词语的必要解释或说明,其内容或词语应以加圈数字的上标形式顺序标出,注释性文字按顺序置于参考文献之前。例:机联网络①。

{5}正文文字请用宋体五号;独立引文用仿宋五号(起四回二)。

注:因版权方要求,不能公开全文,如需全文,请咨询杂志社

微生物学通报

北大期刊
1-3个月下单

关注 17人评论|0人关注
相关期刊
服务与支付