结核分枝杆菌RodA蛋白结构特征的生物信息学分析

关键词：结核分枝杆菌 roda 蛋白结构 抗原性 

摘要：运用生物信息学软件分析及预测结核分枝杆菌Rv0017c基因编码蛋白RodA的结构与功能。采用NCBI、ExPASY、PSORTb等在线工具分析结核分枝杆菌Rv0017c的基因信息,分析其保守域、理化性质和亚细胞定位;利用SOPMA、Vaxijen v2.0等软件预测RodA蛋白的二、三级结构和抗原性。结果表明:Rv0017c基因全长1 410 bp,编码469个氨基酸,分子量为50 610.83,蛋白序列具有高度的保守性。RodA的二级结构中,α螺旋所占比例最多,其次是C无规卷曲结构,而β折叠相对占比很少。RodA并非MTB发挥毒力效应的蛋白因子,但具有较高的抗原性。结论为RodA蛋白序列保守稳定,在结核菌的膜壁形成中发挥巨大作用,且具有较高的抗原性,可作为治疗耐药结核的新靶标。

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