关键词：手足口病 肠道病毒 二代测序 全基因组 

摘要：目的:通过调查近年来我国肠道病毒EV-71型和柯萨奇病毒A16型流行株的全基因组序列,建立一种能够获得我国肠道病毒序列的通用扩增方法,为今后的手足口病流行病学分析、致病机理研究等打下基础。方法:收集我国近5年各地报道的肠道病毒流行株全基因组序列作为参考序列进行比对分析,在保守区设计通用引物,利用3'RACE、长距离PCR扩增及简并引物扩增肠道病毒全基因组序列,采用IonTorrentPGM二代测序仪对扩增产物进行深度测序,以对扩增方法进行验证和评价。结果:通过比对肠道病毒流行株序列设计了通用扩增引物,经二代测序实验获得了肠道病毒全基因组序列;以系列比例模拟混合病毒感染,该扩增方法能够同时获得2株肠道病毒的全基因组序列;能够完整地揭示肠道病毒重组情况。结论:建立了针对我国近年来肠道病毒流行株的通用全基因组扩增方法,在病毒培养液中肠道病毒的提取与扩增中显示了较高的灵敏度,能够反映混合病毒感染、重组病毒的情况。

生物技术通讯杂志要求:

{1}属于课题基金项目的成果或论文，请在首页注明基金项目类别、课题项目名称及编号。如有鸣谢文字请附于文末。

{2}在稿件的修改过程中，若超过稿件修改时限30日，编辑部将以作者返回修改稿日期作为投稿日期；超过30日，编辑部有权对稿件做出退稿处理。

{3}正文的标题层次用阿拉伯数字编号，不同层次的数字之间用下圆点“.”相隔，如“1”，“1.1”，“1.1.2”，并一律左顶格。

{4}中英文摘要（300字左右）；中英文关键词（3-5个）。

{5}作者简介：包括姓名(出生年－)、性别、民族（汉族可省略）、籍贯、工作单位、职称、学位、研究方向。

注：因版权方要求，不能公开全文，如需全文，请咨询杂志社