基于辐射防护基因集的抗辐射损伤先导化合物预测

关键词：先导化合物 辐射防护剂 基因表达谱 转录组数据 lincs计划 

摘要：目的利用基于网络的细胞反应印记整合文库(LINCS)计划的小分子化合物刺激不同细胞系的转录谱数据,构建算法评估化合物的抗辐射损伤活性,发现抗辐射损伤先导化合物。方法基于基因本体(gene ontology,GO)数据库构建辐射防护基因集,并基于基因集富集分析算法构建算法评估化合物的抗辐射损伤潜能,预测具有抗辐射损伤活性的先导化合物。结果建立了4个具有抗辐射损伤效果的辐射防护基因集,以及利用转录组数据预测抗辐射损伤先导化合物的方法;在32 560个小分子化合物中预测获得了299个抗辐射损伤先导化合物,其中17个已被报道具有抗辐射损伤活性。结论预测结果具有较好参考价值;预测方法速度快,成本低,可有效发现具有抗辐射损伤活性的化合物。

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