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缅甸流行区间日疟原虫Duffy结合蛋白的基因多态性和自然选择分析

韦焕苹; 闫妍; 洪明阳; 朱晓彤; 曹雅明 中国医科大学基础医学院免疫学教研室; 辽宁沈阳110122

关键词:间日疟原虫 基因多态性 自然选择 

摘要:为明确缅甸流行区间日疟原虫红内期疫苗候选抗原Duffy结合蛋白(DBP)的基因多态性特点,提取20例缅甸流行区(Bilin和Paletwa)间日疟原虫基因组DNA,通过PCR扩增和测序检测,参考Mandalay流行区(缅甸)相应序列,对pvdbp-Ⅱ基因进行多态性分析。结果表明,各流行区pvdbp-Ⅱ基因的π值分别为0.002、0.009和0.002,且d_N/d_S均大于1。中性检验表明各流行区pvdbp-Ⅱ基因处于阳性选择;pvdbp-Ⅱ基因在Bilin和Mandalay流行区存在基因重组,各流行区群体间存在不同程度的遗传分化,H14是21种不同的单倍型中出现频率最高的单倍型。Pvdbp-Ⅱ基因存在多态并经历阳性选择,提示其作为红内期疫苗候选靶点;H14高频率的出现,提示以其为基础研制pvdbp-Ⅱ基因作为红内期疫苗候选抗原的可能性。

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