关键词：古茶树 snp位点 高通量测序 分子标记 

摘要：为给古茶树遗传图谱构建、分子辅助育种和物种进化等研究提供参考,以48份贵州古茶树种质为研究对象,利用SLAF-seq技术,获取大量多态性SLAF标签,进而开发一批特异性强、稳定性高的单核苷酸多态性(SNP)位点。结果表明,利用猕猴桃参考基因组进行电子酶切预测,选择HaeIII酶进行酶切,得到237773个SLAF标签,其双端比对效率为91.40%,酶切效率为96.41%,说明SLAF建库正常。测序后各样品所获得的读长数为1279534~8460233,测序质量值Q30范围为92.61%~94.88%,均值为93.84%,测序获得的GC比例为43.52%~47.18%。共开发1656258个古茶树SLAF标签,样品的平均测序深度为24.21×,其中多态性SLAF标签有462897个,根据所获得的多态性SLAF标签来统计SNP位点信息,共得到2690638个群体SNP标记,根据完整度大于0.8且次要基因频率(MAF)大于0.05的标准进行过滤,得到283376个高一致性的群体SNP标记。

经济林研究杂志要求:

{1}标题序号按照“一”、“（一）”、“1”、“第一”或“首先”顺序排列，一般不用“①”号。根据文章具体内容，序号可适当减少，但不可反顺序使用。

{2}来稿务必立论正确，论证严谨，论据充分，数据准确，语言通顺，文字流畅，标点符号正确；特别应具有创新性、学术性和前沿性。

{3}摘要是对论文的内容不加注释和评论的简短陈述，不用公式和化学结构式、图表、特殊符号等。表达力求简单、具体，术语规范，一般400字内。

{4}作者是指对论文作出了实质性贡献的人（包括自然人、法人或组织）。作者署名次序原则上以贡献大小决定排序，由论文全体署名作者在投稿前共同商定，投稿后原则上不得变更。

{5}如果来稿为科研项目成果，请在正文标题后打※ 号，用页注的方式提供项目名称以及项目号。

注：因版权方要求，不能公开全文，如需全文，请咨询杂志社