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中国流行的两个进化分支C4亚型EV71病毒3D蛋白氨基酸变异分析

朱颖; 翁育伟 福建省疾病预防控制中心(福建省人兽共患病重点实验室); 福建福州350001

关键词:肠道病毒71型 3d蛋白 氨基酸 变异 

摘要:目的分析不同进化分支肠道病毒71型(EV71)的3D蛋白氨基酸序列的差异,了解潜在毒力相关变异位点。方法从GenBank和实验室收集C4基因亚型EV71全基因序列,以VP1序列做进化分析,统计分析C4a和C4b两进化分支EV71病毒的3D蛋白氨基酸序列。结果共收集病毒序列301株C4型EV71毒株,其中C4a序列293株、C4b序列8株。不同进化分支中3D区有22个氨基酸残基分布有统计学意义。结论两种进化分支C4亚型EV71病毒的3D蛋白,共有22个位点氨基酸变异,其生物学意义有待进一步研究。

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