关键词：帕金森病 额叶 非运动症状 抑郁 生物信息学 

摘要：目的采用生物信息学方法分析帕金森病(Parkinson disease,PD)患者额叶组织的基因表达谱,来探索PD抑郁相关的机制。方法从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库中使用“Parkinson disease”进行检索,并限定组织来源为人类(Homo sapiens)及检测方法为表达谱芯片(Expression profiling by array),获取2019年3月20日前GEO数据库中的所有生物信息数据。使用ImaGEO(Integrative Gene Expression Meta-Analysis fromGEO database)、DAVID(the Database for Annotation,Visualization and Integrated Discovery)、STRING在线工具及Cytoscape 3.6.1软件进行数据分析。结果根据检索条件,获得了2个数据集,共45个样本(PD组24个,健康对照组21个)。与健康对照组相比,PD组的额叶中总共有236个基因表达存在差异,其中146个基因表达水平增高,90个基因表达水平下降。根据基因本体论分析及京都基因和基因组数据库分析,该差异基因主要富集在突触后膜、细胞膜成分、突触后膜密集区、髓鞘等结构。差异基因参与了和PD发生有关的多巴胺能、谷氨酸能及γ-氨基丁酸能等神经突触的生物过程、抑郁的发生过程和多条信号通路(如:丝裂原激活蛋白激酶信号通路、p53信号通路及Wnt信号通路);其中关键蛋白是NFKBIA、NRXN1和RPL35A。结论PD患者额叶的基因表达与PD抑郁发生有关。该研究为进一步理解PD抑郁的发病机制提供了理论依据。

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