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一株新正黏病毒(龙川病毒)的鉴定及分子特征研究

张欣; 刘哲; 谈琦琪; 张欢; 周惠琼; 李柏生; 吴德; 曹玉玺; 王环宇; 梁国栋 广东省疾病预防控制中心病原微生物检验所; 广州511430; 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所; 北京102206

关键词:龙川病毒 致倦库蚊 正黏病毒 分子特征 

摘要:2013年在中国广东省开展了虫媒病毒分布及其分子特征的研究,在广东省龙川县采集的致倦库蚊中分离到一株病毒,该病毒可以引起C6/36细胞的病理性效应。为了对该病毒进行鉴定,并对其分子特征进行研究,将病毒培养物用氯化铯进行梯度离心,负染电镜观察病毒的形态,提取并单引物等温扩增(SPIA)病毒RNA,利用Ion Torrent平台进行深度测序,获得的序列用CLC Genomic Wokbench 9.0软件进行拼接,本地BLAST进行分类比对。用MEGA软件登录GenBank,下载正黏病毒科代表株序列并绘制进化树,同时用ClustalW2软件与新毒株进行氨基酸同源性比对和编码框序列的分析。电镜观察结果显示该病毒呈球形,直径大小约100nm;深度测序共获得6个完整开放阅读框(Open reading fragment,ORF)的节段序列,5个节段(PB1、PB2、PA、NA、HA)的氨基酸序列与正黏病毒科的Quaranjavirus属病毒同源关系在26.38%~67.23%之间,其中PB1的同源性最高,PB2的同源性最低,未发现与其它病毒有同源关系。本研究在中国首次从蚊虫中分离并鉴定了一株新的虫媒病毒,属于正黏病毒科Quaranjavirus属的家族成员,命名为龙川病毒,这是中国国内首次报道从致倦库蚊中分离到龙川病毒。

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